La vegetación de esta región presenta diferentes variedades de especies, destacando el predominio de los bosques de las zonas húmedas frías, como es el caso del sur del Golfo de Penas con bosques de lenga, coigue, tepa y ñirre, y del archipiélago de Los Chonos donde predomina el bosque higrófito de ciprés de las Guaitecas.
Flora
La región de Aisén constituye una importante reserva nacional de vegetación y fauna naturales.Entre el sector occidental de archipiélagos y la vertiente occidental de los Andes, se desarrolla, en virtud de las lluvias elevadas, un bosque denso muy variado en especies (mañío, canelo, ciprés de las Guaitecas, coigüe).
Fauna
En la costa habitan el chungungo y los lobos marinos de uno y dos pelos. En las aguas continentales abundan los coipos.Hacia el interior de la región habita el huemul, existen alrededor de mil ejemplares en total.También se encuentran el zorro, el chingue, el gato montés, la picha y la vizcacha.Entre las aves podemos destacar: la avutarda, el pato silvestre, el cisne, la cata, el traro, el tordo, el zorzal, la diuca y el chinco.
Relieve
La región representa para la fisonomía de nuestro país una realidad única y espectacular debido a su conformación geomorfológica, resultado de la acción combinada de la tectónica, el volcanismo, la acción de glaciares y otros agentes como precipitaciones nivosas y pluviales, el viento y la cercanía al mar. En esta fisonomía tan particular podemos encontrar las siguientes unidades de relieve.


